Pada hari pertama dan kedua dilalui proses seminar yang dibawakan oleh beberapa narasumber lokal maupun nasional. Kemudian dilanjutkan dengan agenda pembahasan yang dilakukan yaitu sidang pleno pembahasan tata tertib yang dipimpin langsung oleh Herwin Tandierung (Presidium nasional Indonesia Timur) dan Zein Al-Kindi (Presidium nasional Jawa timur).
Selanjutnya, pada sidang pleno II yaitu pembahasan mengenai rekomendasi-rekomendasi yang dipimpin oleh Abdul Rahman dari UIM Makassar dan Nurul Amrah dari STAI Al-Gazali Soppeng. Sidang dimulai dengan pembagian komisi yang selanjutnya membagi menjadi dua komisi yakni komisi A yang membahas tentang evaluasi pengembangan dan strategi BEM PTNU se NUsantara. Sedangkan komisi B membahas tentang rekomendasi dan kebijakan umum BEM PTNU se NUsantara.
Pada pemaparan hasil dari sidang komisi A diwarnai perdebatan alot dari para peserta. Terutama perwakilan dari STAI Syarifuddin Lumajang Jawa Tengah dalam hal ini diwakili oleh Ainun Nadjib dan M. Ali Fatkhurozi dari UNIPDU Jombang Jatim.
Menurut Nadjib bahwa pada point dua mengenai diperlukannya pelatihan mahasiswa PTNU baik itu ditingkatan kultur maupun struktur tidak perlu dicantumkan. Karena mengingat BEM PTNU adalah bukan organisasi kader. Tetapi, hal tersebut kemudian disanggah oleh Ali Fatkhurozi yang mengemukakan bahwa pelaksanaan kongres, munas, mukernas, maupun pertemuan nasional lainnya adalah merupakan sebuah proses kaderisasi. Selain itu ditambahkannya pula bahwa pelatihan sangat diperlukan karena mengingat iklim persaingan generasi kedepan sudah semakin kompetitif, dan dibutuhkan kapasitas mumpuni dari seluruh generasi muda Nahdiyyin untuk menghadapi iklim tersebut.
Tercatat beberapa Universitas yang hadir yaitu UIM Al-Gazali Makassar, STAI Al-Gazali Bulukumba, Universitas Malang Jawa timur (Jatim), STAI Syarifuddin Lumajang Jawa Tengah, Universitas Islam Jember, STAI Syaichona Cholil, Universitas Tomakaka Mamuju, STAIMIDYA Madura, STAI Al-Gazali Soppeng, UNIPDU Jombang Jatim, dan beberapa perguruan tinggi NU lainnya.(*)